去年大法官發布第650號解釋，認定公司無償借貸資金給股東需設算利息收入違憲，不符租稅法定主義。於是財政部將設算利息收入條款納入所得稅法，條文已經生效，從今年5月29日起，公司借貸資金未收取利息，仍會被國稅局設算利息收入補稅。
母子公司借貸頻繁，常遭補稅罰款，尤其是營建、化工、傳產等行業，去年在高等行政法案的類似案件就高達50件。大法官會議去年決議，此設算利息收入並未載明於法律中，只以行政命令訂定，違反租稅法定主義，未確定案件一律撤銷。
於是財政部去年底提出修法，新所得稅法已經生效。所得稅法第24條之3第2項規定，公司之資金貸與股東或任何他人未收取利息，或約定之利息偏低者，除屬預支職工薪資者外，應按資金貸與期間所屬年度1月1日台灣銀行之基準利率計算公司利息收入課稅。台北市國稅局特別提醒公司注意。
舉例來說，甲公司在98年1月1日將自有資金100萬元無償提供給非關係人乙公司使用，按照稅法規定，甲公司98年度應按台灣銀行98年1月1日基準利率4.026%設算利息收入課稅，利息收入共計為2萬3,825元｛100萬元×4.026%×（216天／365天）｝，216天是從98年5月29日起算，至12月31日止。
國稅局進一步指出，若交易雙方屬於母子公司或關係企業，應依不合常規移轉訂價查核準則規定辦理。
若交易雙方並非關係人，公司是以借入的資金轉貸給他人，依據營所稅查核準則第97條第11款規定，相當於該貸出款項所支付的利息，不予認定為費用。
國稅局也提醒，股東若無償從公司取得資金，依所得稅法第4條第1項第17款規定，應申報個人綜合所得稅。因此，個人名下財產和公司資金應清楚區分，若無償將公司資金挪作個人使用，又無足以證明是借貸關係者，將可能被認定是公司贈與財產給個人，依所得稅法規定核屬個人的「其他所得」，若未依規定申報綜合所得稅，一旦遭查獲除補稅外尚須處罰。
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